分子模拟及药物设计综合软件
MOE （Molecular Operating Environment）分子操作环境，是由加拿大化学计算集团公司Chemical Computing Group ULC.开发的针对制药和生命科学的综合软件系统。它是一个综合的应用环境和技术开发平台，集可视化、模拟和应用开发于一体。
MOE 在统一的操作环境下能通过分子模拟、蛋白质结构分析、小分子数据处理以及蛋白质与小分子对接研究等应用工具全方位支持小分子药物及生物药设计。
分子建模及模拟
- 分子力学及量化计算
- 自动化的蛋白及小分子结构准备
- 分子动力学模拟及结合自由能计算
- 小分子柔性叠合
- 小分子构象搜索
- 二面角扫描及分析
- 基于QM 方法的NMR,IR 和VCD 质谱模拟
蛋白及抗体设计
- 蛋白及抗体同源模建
- 基于结构的蛋白设计
- 抗体人源化设计
- 抗体Liabilities 及Developability 评估
- 亲和力、稳定性及水溶性优化
- 高通量抗体突变设计
- 蛋白-蛋白对接及抗原表位预测
- ADC 及融合蛋白模拟
基于结构的药物设计
- 流程化的小分子设计界面
- 结合位点预测及分析
- 交互式的化合物设计
- 蛋白小分子相互作用图谱
- 水分子位点预测及能量分析
- 分子对接
- 骨架替换、片段链接、片段生长及等电排体转化等
高通量虚拟筛选
- 组合库设计
- 小分子构象数据库生成
- 分子描述符、指纹图谱计算及筛选
- QSAR 模型构建及筛选
- 3D 药效团构建及筛选
- 小分子对接
- 小分子类药性预测
化学信息学及QSAR
- 400+ 的2D和3D 分子描述符
- PKa预测及质子化状态生成
- 线性QSAR、贝叶斯分类及其他机器学习算法
- MOEsaic – 基于网页端的SAR 分析及可视化工具
- 化合物相似度、多样性分析及聚类
数据库及定制化开发
- 类药小分子数据库
- 化合物片段数据库、linker数据库
- 大分子蛋白家族数据库
- 整合化学敏感的SVL 编程语言
- 可定制化的功能和界面
- 整合第三方工具及提供API 及Web服务
- 个人电脑 – 集群 – 云端皆可部署使用
- 支持Windows – Linux – MacOS 操作系统
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